MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus infantarius subsp. infantarius CJ18 plasmid pSICJ18-1

Total Repeats: 337

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016837	TTA	2	6	187	192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704342
2	NC_016837	TTGC	2	8	205	212	0 %	50 %	25 %	25 %	379704342
3	NC_016837	AAC	2	6	278	283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704342
4	NC_016837	AAG	2	6	317	322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704342
5	NC_016837	AAGG	2	8	611	618	50 %	0 %	50 %	0 %	379704343
6	NC_016837	ACA	2	6	638	643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704343
7	NC_016837	AGTC	2	8	644	651	25 %	25 %	25 %	25 %	379704343
8	NC_016837	CAAAGG	2	12	733	744	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379704343
9	NC_016837	AT	3	6	799	804	50 %	50 %	0 %	0 %	379704343
10	NC_016837	TATT	2	8	854	861	25 %	75 %	0 %	0 %	379704343
11	NC_016837	AT	3	6	907	912	50 %	50 %	0 %	0 %	379704343
12	NC_016837	GCT	2	6	914	919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704343
13	NC_016837	CGAG	2	8	962	969	25 %	0 %	50 %	25 %	379704343
14	NC_016837	A	6	6	977	982	100 %	0 %	0 %	0 %	379704343
15	NC_016837	TTTA	2	8	1065	1072	25 %	75 %	0 %	0 %	379704343
16	NC_016837	GTC	2	6	1091	1096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704343
17	NC_016837	TTA	2	6	1104	1109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704343
18	NC_016837	TAT	3	9	1125	1133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704343
19	NC_016837	TGT	2	6	1134	1139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704343
20	NC_016837	TGTT	2	8	1206	1213	0 %	75 %	25 %	0 %	379704343
21	NC_016837	G	6	6	1242	1247	0 %	0 %	100 %	0 %	379704343
22	NC_016837	TGG	2	6	1303	1308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704343
23	NC_016837	ATT	2	6	1337	1342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704343
24	NC_016837	GATGAA	2	12	1415	1426	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379704343
25	NC_016837	T	7	7	1483	1489	0 %	100 %	0 %	0 %	379704343
26	NC_016837	CAT	2	6	1551	1556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704343
27	NC_016837	TCT	2	6	1633	1638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704343
28	NC_016837	ATT	2	6	1645	1650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704343
29	NC_016837	ATTC	2	8	1726	1733	25 %	50 %	0 %	25 %	379704343
30	NC_016837	ATT	2	6	1808	1813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704343
31	NC_016837	CA	3	6	1841	1846	50 %	0 %	0 %	50 %	379704343
32	NC_016837	AAT	2	6	1865	1870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704343
33	NC_016837	TCT	2	6	1878	1883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704343
34	NC_016837	ATT	2	6	1915	1920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704343
35	NC_016837	ATG	2	6	1922	1927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704343
36	NC_016837	GATTG	2	10	2026	2035	20 %	40 %	40 %	0 %	379704343
37	NC_016837	T	7	7	2053	2059	0 %	100 %	0 %	0 %	379704343
38	NC_016837	TCG	2	6	2118	2123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704343
39	NC_016837	TAC	2	6	2130	2135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704343
40	NC_016837	ATT	2	6	2150	2155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704343
41	NC_016837	A	6	6	2174	2179	100 %	0 %	0 %	0 %	379704343
42	NC_016837	AATT	2	8	2187	2194	50 %	50 %	0 %	0 %	379704343
43	NC_016837	TGA	2	6	2226	2231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704344
44	NC_016837	AAGC	2	8	2299	2306	50 %	0 %	25 %	25 %	379704344
45	NC_016837	ACAA	2	8	2435	2442	75 %	0 %	0 %	25 %	379704344
46	NC_016837	A	6	6	2463	2468	100 %	0 %	0 %	0 %	379704344
47	NC_016837	TTA	2	6	2642	2647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704344
48	NC_016837	TTGTA	2	10	2939	2948	20 %	60 %	20 %	0 %	379704345
49	NC_016837	AGC	2	6	2979	2984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704345
50	NC_016837	CAT	2	6	3008	3013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704345
51	NC_016837	TAA	2	6	3014	3019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704345
52	NC_016837	CAT	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704345
53	NC_016837	AAG	2	6	3208	3213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704345
54	NC_016837	A	6	6	3275	3280	100 %	0 %	0 %	0 %	379704345
55	NC_016837	CTT	2	6	3311	3316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704345
56	NC_016837	CCAT	2	8	3341	3348	25 %	25 %	0 %	50 %	379704345
57	NC_016837	TTA	2	6	3352	3357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704345
58	NC_016837	ATTA	2	8	3381	3388	50 %	50 %	0 %	0 %	379704345
59	NC_016837	TGT	2	6	3419	3424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704345
60	NC_016837	TTTATA	2	12	3429	3440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704345
61	NC_016837	ATA	2	6	3505	3510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704345
62	NC_016837	TAT	2	6	3515	3520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704345
63	NC_016837	TCT	2	6	3584	3589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704345
64	NC_016837	GA	3	6	3592	3597	50 %	0 %	50 %	0 %	379704345
65	NC_016837	TC	4	8	3601	3608	0 %	50 %	0 %	50 %	379704345
66	NC_016837	TTG	2	6	3612	3617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704345
67	NC_016837	GAC	2	6	3626	3631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704345
68	NC_016837	ATG	2	6	3705	3710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704345
69	NC_016837	AC	3	6	4379	4384	50 %	0 %	0 %	50 %	379704346
70	NC_016837	TTA	2	6	4419	4424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704346
71	NC_016837	T	6	6	4442	4447	0 %	100 %	0 %	0 %	379704346
72	NC_016837	CAA	2	6	4461	4466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704346
73	NC_016837	AAC	2	6	4492	4497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704346
74	NC_016837	AGC	3	9	4508	4516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704346
75	NC_016837	AAAC	2	8	4535	4542	75 %	0 %	0 %	25 %	379704346
76	NC_016837	TGC	2	6	4573	4578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704346
77	NC_016837	ATG	2	6	4590	4595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704346
78	NC_016837	CAA	2	6	4637	4642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704346
79	NC_016837	A	6	6	4658	4663	100 %	0 %	0 %	0 %	379704346
80	NC_016837	TCT	2	6	4713	4718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704346
81	NC_016837	TTG	2	6	4731	4736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704346
82	NC_016837	AGCA	2	8	4761	4768	50 %	0 %	25 %	25 %	379704346
83	NC_016837	TA	3	6	4827	4832	50 %	50 %	0 %	0 %	379704346
84	NC_016837	A	6	6	4871	4876	100 %	0 %	0 %	0 %	379704346
85	NC_016837	GAAA	2	8	4923	4930	75 %	0 %	25 %	0 %	379704346
86	NC_016837	TAT	2	6	4961	4966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704346
87	NC_016837	AAG	2	6	5048	5053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704346
88	NC_016837	ATTC	2	8	5091	5098	25 %	50 %	0 %	25 %	379704346
89	NC_016837	A	6	6	5102	5107	100 %	0 %	0 %	0 %	379704346
90	NC_016837	A	6	6	5211	5216	100 %	0 %	0 %	0 %	379704346
91	NC_016837	CAAA	2	8	5217	5224	75 %	0 %	0 %	25 %	379704346
92	NC_016837	AGC	2	6	5233	5238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704346
93	NC_016837	A	6	6	5240	5245	100 %	0 %	0 %	0 %	379704346
94	NC_016837	AAAG	2	8	5260	5267	75 %	0 %	25 %	0 %	379704346
95	NC_016837	CTT	2	6	5319	5324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704346
96	NC_016837	CAA	2	6	5336	5341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704346
97	NC_016837	ACA	2	6	5473	5478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704346
98	NC_016837	TCT	2	6	5490	5495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704346
99	NC_016837	ACT	2	6	5541	5546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704346
100	NC_016837	AAG	2	6	5637	5642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704346
101	NC_016837	TGA	2	6	6038	6043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704347
102	NC_016837	GTT	2	6	6084	6089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704347
103	NC_016837	TTA	2	6	6162	6167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704348
104	NC_016837	CTG	2	6	6214	6219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704348
105	NC_016837	A	6	6	6244	6249	100 %	0 %	0 %	0 %	379704348
106	NC_016837	AT	3	6	6265	6270	50 %	50 %	0 %	0 %	379704348
107	NC_016837	A	6	6	6408	6413	100 %	0 %	0 %	0 %	379704349
108	NC_016837	TTA	2	6	6424	6429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704349
109	NC_016837	TAA	2	6	6446	6451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704349
110	NC_016837	TAA	2	6	6459	6464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704349
111	NC_016837	ATT	2	6	6488	6493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704349
112	NC_016837	TAA	3	9	6524	6532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704349
113	NC_016837	ATT	2	6	6559	6564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704349
114	NC_016837	TTC	2	6	6581	6586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704349
115	NC_016837	TAA	2	6	6611	6616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704349
116	NC_016837	A	7	7	6650	6656	100 %	0 %	0 %	0 %	379704349
117	NC_016837	TTTAA	2	10	6661	6670	40 %	60 %	0 %	0 %	379704349
118	NC_016837	ATT	2	6	6710	6715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704349
119	NC_016837	TTA	2	6	6797	6802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704350
120	NC_016837	AT	3	6	6803	6808	50 %	50 %	0 %	0 %	379704350
121	NC_016837	GTT	2	6	6818	6823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704350
122	NC_016837	AAG	2	6	6886	6891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704350
123	NC_016837	TCC	2	6	6925	6930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379704350
124	NC_016837	GTC	2	6	6933	6938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704350
125	NC_016837	CAAA	2	8	7014	7021	75 %	0 %	0 %	25 %	379704350
126	NC_016837	TCC	2	6	7130	7135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379704350
127	NC_016837	TTC	2	6	7140	7145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704350
128	NC_016837	ACA	2	6	7166	7171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704350
129	NC_016837	T	6	6	7225	7230	0 %	100 %	0 %	0 %	379704350
130	NC_016837	T	6	6	7257	7262	0 %	100 %	0 %	0 %	379704350
131	NC_016837	T	6	6	7273	7278	0 %	100 %	0 %	0 %	379704350
132	NC_016837	T	7	7	7344	7350	0 %	100 %	0 %	0 %	379704350
133	NC_016837	TAG	2	6	7602	7607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704351
134	NC_016837	CAA	2	6	7633	7638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704351
135	NC_016837	TAT	3	9	7649	7657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704351
136	NC_016837	ATC	2	6	7700	7705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704351
137	NC_016837	ATA	2	6	7836	7841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704352
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152	NC_016837	CTT	2	6	8526	8531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704354
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252	NC_016837	TA	4	8	14655	14662	50 %	50 %	0 %	0 %	379704367
253	NC_016837	A	6	6	14662	14667	100 %	0 %	0 %	0 %	379704367
254	NC_016837	TAT	2	6	14731	14736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704367
255	NC_016837	A	7	7	14748	14754	100 %	0 %	0 %	0 %	379704367
256	NC_016837	GA	3	6	14826	14831	50 %	0 %	50 %	0 %	379704367
257	NC_016837	TGGAT	2	10	14864	14873	20 %	40 %	40 %	0 %	379704367
258	NC_016837	A	9	9	14891	14899	100 %	0 %	0 %	0 %	379704367
259	NC_016837	TAC	2	6	14902	14907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704367
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263	NC_016837	ATT	2	6	15069	15074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704368
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265	NC_016837	CAG	2	6	15263	15268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704369
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267	NC_016837	A	6	6	15341	15346	100 %	0 %	0 %	0 %	379704369
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.